在iso体系认证中，企业通常会遇到以下常见问题：

1. 理解和应用标准要求：iso标准的要求内容繁多且复杂，企业需要对其进行全面理解，并将其应用到实际操作中。这可能需要培训和指导，以确保员工正确理解和应用标准要求。

2. 法规和法律要求：在进行iso体系认证时，企业必须遵守相关的国家和地区法律法规要求。企业需要了解并确保其操作符合法律要求，以便通过iso认证审核。

3. 文件编制和记录管理：iso体系认证要求企业建立一系列文件和记录，例如程序文件、工作指导书、工作记录等等。管理这些文件和记录并保持其有效性是一项复杂的任务，需要合适的管理系统和流程来确保文件的正确编制和及时更新。

4. 内部审计和管理评审：企业需要定期进行内部审计，以确保其iso体系的有效运行。然而，对内部审计和管理评审的理解和应用可能是一项挑战，需要对iso标准的要求有深入了解，同时也需要培训员工并确保他们具备相关的技能和经验。

5. 供应商管理：iso体系认证要求企业与供应商建立合作关系，并对供应链进行管理和控制。然而，如何选择合适的供应商，如何与供应商进行有效的沟通和管理，成为企业在实施iso体系时需要解决的问题之一。

6. 风险管理：iso标准在管理体系中强调风险管理的重要性。企业需要识别和评估各种风险，并采取适当的措施来降低风险。然而，风险管理包括许多细节和复杂的过程，需要企业投入大量的时间和资源。

7. 员工参与和培训：iso标准要求企业充分发挥员工的作用，并鼓励员工参与和关注管理体系的运行。为了达到这一要求，企业需要培训员工，提高他们的意识和技能，使他们能够更好地理解和应用iso体系。

8. 持续改进：iso体系认证是一个持续改进的过程。企业必须不断寻求改善的机会，并采取适当的措施来增加其运营的效率和效果。然而，如何寻找改进的机会，并将其转化为实际的改善措施，可能是一项具有挑战性的任务。

9. 沟通和沟通流程：iso体系认证要求企业建立有效的沟通流程，以便员工之间以及与相关方之间进行有效的沟通。然而，在建立和管理有效的沟通流程方面，企业可能会遭遇一些困难，因为不同的员工和相关方可能有不同的需求和期望。

10. 监控和测量：iso标准强调对过程和绩效进行监控和测量的重要性。企业需要建立适当的监控和测量方法，并根据这些结果进行相应的改善。然而，选择合适的监控和测量方法，并培训员工正确使用这些方法，可能需要一定的专业知识和技能。

总之，在进行iso体系认证时，企业可能会面临许多挑战和困难。这需要企业充分了解iso标准的要求，并制定合适的策略和措施来应对这些问题。同时，企业还需要培训和指导员工，提高他们的认识和技能，确保他们能够有效地应用iso体系。只有这样，企业才能顺利通过iso认证审核，实现其管理体系的有效运作。